1、种子选择。首先在种植萝卜的时候，肯定要选择抗病性比较强且适合当地条件的品种。其次要注意，萝卜霜霉病的病菌还可附着在种子上越冬，带菌的种子可以直接侵染幼苗，所以在选择种子的时候也要注意种子的质量。播种之前，也要进行种子处理，比如用种子重量0.4%的50%可湿性粉剂福美双、或75%可湿性粉剂百菌清进行拌种灭菌。
2、农业防治。进行合理的田间管理，合理灌水施肥，进行秋季深翻，合理规定种植密度。其次要施行轮作制度，避免病害不断积累加重。因为萝卜是十字花科的作物，所以除了与非萝卜种类轮作之外，还要避免与白菜类作物连作。萝卜不宜早播，尤其是在在霜霉病常发区及比较干旱缺水的年份，播期应当适当延后一两天。
3、化学防治。在做了预防工作，病害依旧发生之后，化学防治就成了关键的手段。萝卜霜霉病有明显的中心特征，所以在发病初期或发现中心病株时，摘除病叶并立即喷药防治，防治病害的蔓延发展。常用药剂有：75%百菌清可湿性粉剂600倍液，64%杀毒钒可湿性粉剂500倍液，72%霜脲·锰锌可湿性粉剂600-800倍液，65%代森锌可湿性粉剂600~800倍液等等，用药时注意交替施用。
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