在革兰氏染色中，蓝色是由于在细菌表面覆盖了一层蓝色的细菌外膜所形成的。这种蓝色的细菌外膜通常由革兰氏阳性菌（G+菌）产生，而革兰氏阴性菌（G-菌）则不会产生这种蓝色的细菌外膜。
在革兰氏染色中，如果将细菌涂成革兰氏阳性菌（G+菌），细菌表面会形成一层蓝色的细菌外膜，而如果将细菌涂成革兰氏阴性菌（G-菌），细菌表面会形成一层红色的细菌外膜。因此，革兰氏染色中的蓝色通常是指革兰氏阳性菌的细菌外膜所形成的颜色。
革兰氏染色（Gram Staining）是用来鉴别细菌的一种方法：这种染色法利用细菌细胞壁上的生物化学性质不同，可将细菌分成两类，即革兰氏阳性（Gram Positive）与革兰氏阴性（Gram Negative）。这一染色方法由丹麦医生汉斯·克里斯蒂安·革兰于1884年所发明，最初是用来鉴别肺炎球菌与克雷白氏肺炎菌之间的关系，后推广为鉴别细菌种类的重要特性之一，对由细菌感染引起的疾病的临床诊断及治疗有着广泛用途。
革兰氏染色的步骤及结果对照
载玻片纱布擦干，涂菌部位火焰除油。
把菌液涂抹在载玻片上，接种环要在火焰中灭菌。
让涂片自然干燥。
菌膜朝上，用火焰固定2-3次。
把固定过的图片放报纸上，加草酸铵结晶液，染色1分钟。
用水缓慢冲洗载玻片上的染色液，吸水纸吸干。
加一滴碘液，染色1分钟，水洗。
吸残留水，加95%乙醇脱色半分钟，流出液体无紫色后，立即水洗。
加蕃红染色四分钟，水洗。
革兰氏染色完成，观察即可。
革兰氏阳性菌为蓝紫色，阴性菌为红色。
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