上海交通大学数学系成立于1928年, 对中国近代数学的发展作出过重要贡献，中国第一次数学会就在上海交大召开。
1952年院系调整，数学系大部分师生被调整到复旦大学和华东师范大学。1956年，交大西迁，副校长张鸿教授首次将交大教学传统归纳为门槛高，基础厚，要求严。1978年9月，重新组建应用数学系；2001年冬恢复为数学系。
百年来交大数学系桃李芬芳，知名校友中有获得国家最高科技奖的吴文俊院士、胡和生院士及龚升等著名数学家；也有神华集团总裁凌文、红杉中国基金创始人沈南鹏等杰出企
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